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    白腐真菌降解麥麩纖維關鍵基因挖掘

    宋鑫  蘇浩  蔣詩雨  李力  
    【摘要】:白腐真菌是已知能高效降解木質纖維素的微生物之一,為預測和篩選白腐真菌與麥麩纖維降解有關的基因,對白腐菌A. polytricha 5.584分別以麥麩纖維和葡萄糖為單一碳源的液態培養環境下的轉錄組進行高通量測序,并利用GO等數據庫對轉錄本進行比較分析。轉錄組測序共得到38.18 Gb數據,各樣品的Clean Reads與參考基因組的比對效率在 86.29%~88.85%之間,FPKM密度分布表明分組合理且組間存在差異;使用DEGseq篩選差異表達基因,并與七大功能數據庫系統開展比對注釋,共得到上調基因8214條,下調基因3882條,其中有8638個被注釋到GO數據庫,4310個被注釋到KEGG數據庫;使用DIAMOND軟件對差異表達基因進行蛋白互作分析,篩選出互作關系評分≥300的網絡關系作圖,得到5個與白腐菌降級麥麩纖維相關的重要關鍵基因CL16.Contig1_All、CL1024.Contig1_All、CL2915.Contig1_All、CL710.Contig10_All、CL3860.Contig3_All,為深入研究白腐菌對麥麩膳食纖維的降解機制提供參考。

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